Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC34.29■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
C9orf84Q5VXU9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
C9orf84Q5VXU9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms