Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOCADQ5VW36 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms