Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GKAP1Q5VSY0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms