Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
STRIP1Q5VSL9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
STRIP1Q5VSL9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms