Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LDLRAD1Q5T700 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms