Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC3LQ5T215 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC3LQ5T215 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms