Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms