Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNT2

TMEM201, Transmembrane protein 201, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201Q5SNT2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM201Q5SNT2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM201Q5SNT2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM201Q5SNT2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM201Q5SNT2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM201Q5SNT2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMEM201Q5SNT2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM201Q5SNT2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms