Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms