Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms