Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms