Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC178Q5BJE1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC178Q5BJE1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms