Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf46Q504U0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf46Q504U0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf46Q504U0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf46Q504U0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf46Q504U0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf46Q504U0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf46Q504U0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf46Q504U0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf46Q504U0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf46Q504U0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf46Q504U0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf46Q504U0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf46Q504U0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf46Q504U0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms