Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GREB1Q4ZG55 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms