Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KHDC1Q4VXA5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KHDC1Q4VXA5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms