Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TPRNQ4KMQ1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
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