Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DUSP28Q4G0W2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUSP28Q4G0W2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms