Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
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