Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIL3Q16649 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIL3Q16649 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
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