Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGCAQ16586 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SGCAQ16586 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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SGCAQ16586 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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SGCAQ16586 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SGCAQ16586 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SGCAQ16586 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SGCAQ16586 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SGCAQ16586 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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SGCAQ16586 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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SGCAQ16586 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
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SGCAQ16586 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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SGCAQ16586 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCAQ16586 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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