Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN9AQ15858 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN9AQ15858 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
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