Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC1Q15751 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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