Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCAPHQ15003 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCAPHQ15003 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms