Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
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