Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GBX1Q14549 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms