Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53BQ14153 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53BQ14153 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM53BQ14153 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53BQ14153 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53BQ14153 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53BQ14153 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53BQ14153 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53BQ14153 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53BQ14153 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53BQ14153 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53BQ14153 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM53BQ14153 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53BQ14153 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53BQ14153 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53BQ14153 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53BQ14153 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM53BQ14153 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53BQ14153 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53BQ14153 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53BQ14153 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53BQ14153 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53BQ14153 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53BQ14153 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53BQ14153 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53BQ14153 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53BQ14153 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53BQ14153 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM53BQ14153 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53BQ14153 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53BQ14153 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53BQ14153 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53BQ14153 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM53BQ14153 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM53BQ14153 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM53BQ14153 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM53BQ14153 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAM53BQ14153 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM53BQ14153 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM53BQ14153 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAM53BQ14153 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM53BQ14153 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 232.7 ms