Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A6Q14031 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
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