Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDAP1Q13442 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDAP1Q13442 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms