Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SF3B2Q13435 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SF3B2Q13435 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
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