Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRSQ13332 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRSQ13332 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms