Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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