Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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