Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 RRP17YDR412W 708 nt4.91□□□□□ -1.62
LCB4Q12246 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt4.91□□□□□ -1.62
LCB4Q12246 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt4.91□□□□□ -1.62
LCB4Q12246 CLC1YGR167W 702 nt4.91□□□□□ -1.62
LCB4Q12246 CIA2YHR122W 696 nt4.91□□□□□ -1.62
LCB4Q12246 PHO86YJL117W 936 nt4.91□□□□□ -1.62
LCB4Q12246 AIM23YJL131C 1071 nt4.91□□□□□ -1.62
LCB4Q12246 RPF2YKR081C 1035 nt4.91□□□□□ -1.62
LCB4Q12246 YMR245WYMR245W 621 nt4.91□□□□□ -1.62
LCB4Q12246 YNL174WYNL174W 573 nt4.91□□□□□ -1.62
LCB4Q12246 SSU72YNL222W 621 nt4.91□□□□□ -1.62
LCB4Q12246 ZPS1YOL154W 750 nt4.91□□□□□ -1.62
LCB4Q12246 MPD1YOR288C 957 nt4.91□□□□□ -1.62
LCB4Q12246 MET31YPL038W 534 nt4.91□□□□□ -1.62
LCB4Q12246 CTS2YDR371W 1536 nt4.91□□□□□ -1.62
LCB4Q12246 RIT1YMR283C 1542 nt4.91□□□□□ -1.62
LCB4Q12246 IFM1YOL023W 2031 nt4.9□□□□□ -1.62
LCB4Q12246 GRS1YBR121C 2004 nt4.9□□□□□ -1.62
LCB4Q12246 GCR2YNL199C 1605 nt4.9□□□□□ -1.62
LCB4Q12246 CLN2YPL256C 1638 nt4.9□□□□□ -1.62
LCB4Q12246 SCS2YER120W 735 nt4.9□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 YKL071WYKL071W 771 nt4.9□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 YBL077WYBL077W 432 nt4.9□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 TLG2YOL018C 1194 nt4.9□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 MDY2YOL111C 639 nt4.9□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 BTS1YPL069C 1008 nt4.9□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 SUE1YPR151C 621 nt4.9□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 BUD7YOR299W 2241 nt4.9□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 EIS1YMR031C 2532 nt4.9□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 PRM2YIL037C 1971 nt4.89□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 SIR1YKR101W 1965 nt4.89□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 NTH2YBR001C 2343 nt4.89□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 SLC1YDL052C 912 nt4.89□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 YDL158CYDL158C 309 nt4.89□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 AIR2YDL175C 1035 nt4.89□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 TIP20YGL145W 2106 nt4.89□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 YGR283CYGR283C 1026 nt4.89□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 RPS0BYLR048W 759 nt4.89□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 BUB3YOR026W 1026 nt4.89□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 DCI1YOR180C 816 nt4.89□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt4.89□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt4.89□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 PRM1YNL279W 1986 nt4.89□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 UBP7YIL156W 3216 nt4.89□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 ROT2YBR229C 2865 nt4.88□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 PHO90YJL198W 2646 nt4.88□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 BUD30YDL151C 582 nt4.88□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 NUP42YDR192C 1293 nt4.88□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 PCT1YGR202C 1275 nt4.88□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 TRX2YGR209C 315 nt4.88□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 RHO3YIL118W 696 nt4.88□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 DID4YKL002W 699 nt4.88□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 EBP2YKL172W 1284 nt4.88□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 TIS11YLR136C 858 nt4.88□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 CPR6YLR216C 1116 nt4.88□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 ATG29YPL166W 642 nt4.88□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 NHP6AYPR052C 282 nt4.88□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 SLX1YBR228W 915 nt4.88□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 ACS2YLR153C 2052 nt4.88□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 HES1YOR237W 1305 nt4.88□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 RNY1YPL123C 1305 nt4.88□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 MET3YJR010W 1536 nt4.87□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 LUC7YDL087C 786 nt4.87□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 PIB1YDR313C 861 nt4.87□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 PAN5YHR063C 1140 nt4.87□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 SEC28YIL076W 891 nt4.87□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 SFH5YJL145W 885 nt4.87□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 HEK2YBL032W 1146 nt4.87□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 YIF1YNL263C 945 nt4.87□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 GSP2YOR185C 663 nt4.87□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 ENV9YOR246C 993 nt4.87□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 SED4YCR067C 3198 nt4.87□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 ENT5YDR153C 1236 nt4.86□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 BUD26YDR241W 288 nt4.86□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 YPR1YDR368W 939 nt4.86□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 HAT2YEL056W 1206 nt4.86□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 DBP8YHR169W 1296 nt4.86□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 GMH1YKR030W 822 nt4.86□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 SPS18YNL204C 903 nt4.86□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 ATG14YBR128C 1035 nt4.86□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 snR32snR32 188 nt4.86□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 THI22YPR121W 1719 nt4.86□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 SAS10YDL153C 1833 nt4.86□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 GMC1YDR506C 1827 nt4.86□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 YMR102CYMR102C 2505 nt4.85□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 YIL028WYIL028W 399 nt4.85□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 RPC17YJL011C 486 nt4.85□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.85□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 ATG16YMR159C 453 nt4.85□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 YNL226WYNL226W 411 nt4.85□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 PDR16YNL231C 1056 nt4.85□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 TEX1YNL253W 1269 nt4.85□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 ASA1YPR085C 1332 nt4.85□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 PRP9YDL030W 1593 nt4.85□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 EKI1YDR147W 1605 nt4.85□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 VAN1YML115C 1608 nt4.85□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 CNA1YLR433C 1662 nt4.85□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 GIP1YBR045C 1920 nt4.85□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 SWI3YJL176C 2478 nt4.85□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 EXO1YOR033C 2109 nt4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.1 ms