Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 HRI1YLR301W 735 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 TAF13YML098W 504 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 PEP12YOR036W 867 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 snR31snR31 225 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 PYK2YOR347C 1521 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 POB3YML069W 1659 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YBL111CYBL111C 2004 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 ADY3YDL239C 2373 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 GUP2YPL189W 1830 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 FUR1YHR128W 651 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YHR214WYHR214W 612 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 BET1YIL004C 429 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 PRM10YJL108C 1152 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YAR066WYAR066W 612 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 FUS3YBL016W 1062 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 GIM3YNL153C 390 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 SIR1YKR101W 1965 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 EAR1YMR171C 1653 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 RAD18YCR066W 1464 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YPQ2YDR352W 954 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 ARP1YHR129C 1155 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 EAF6YJR082C 342 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 RPC37YKR025W 849 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 COS10YNR075W 1125 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 TSR4YOL022C 1227 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 NGL1YOL042W 1092 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 PSF3YOL146W 585 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 SFM1YOR021C 642 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 CWC27YPL064C 906 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 snR30snR30 606 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YCR064CYCR064C 411 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 HMRA2YCR096C 360 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 BSC1YDL037C 987 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 MRPL7YDR237W 879 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 PEA2YER149C 1263 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 PEX4YGR133W 552 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 CIA2YHR122W 696 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 ECM14YHR132C 1293 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 ATG27YJL178C 816 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 ARV1YLR242C 966 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YBL070CYBL070C 321 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 TRS33YOR115C 807 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 MLC2YPR188C 492 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YMR046CYMR046C 1323 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 LRO1YNR008W 1986 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 GLR1YPL091W 1452 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 ASM4YDL088C 1587 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 GAA1YLR088W 1845 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 VMA21YGR105W 234 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YHR127WYHR127W 732 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 URA1YKL216W 945 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 PBA1YLR199C 831 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 YPQ1YOL092W 927 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 DCC1YCL016C 1143 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 IML2YJL082W 2196 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-BRQ12217 CYS4YGR155W 1524 nt6.9□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 BOP2YLR267W 1713 nt6.9□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 RAD30YDR419W 1899 nt6.9□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 MSB3YNL293W 1902 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 KNH1YDL049C 807 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 HMO1YDR174W 741 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 YER046W-AYER046W-A 330 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 FYV4YHR059W 393 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 NCA3YJL116C 1014 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 YLR287CYLR287C 1068 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 ECM19YLR390W 339 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 CMC2YBL059C-A 330 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 YBL096CYBL096C 309 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 ECM23YPL021W 564 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 YBR062CYBR062C 543 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 PEX31YGR004W 1389 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 MEP1YGR121C 1479 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 UGO1YDR470C 1509 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 CDC19YAL038W 1503 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 RIB2YOL066C 1776 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 MRE11YMR224C 2079 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 PRI2YKL045W 1587 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 YDR199WYDR199W 366 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 PRP18YGR006W 756 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 SPO13YHR014W 876 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 APS2YJR058C 444 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 RPC34YNR003C 954 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 ATG3YNR007C 933 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 CTF19YPL018W 1110 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 ROX1YPR065W 1107 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 RPO26YPR187W 468 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 FCP1YMR277W 2199 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 RVB2YPL235W 1416 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 TIF3YPR163C 1311 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 ATG31YDR022C 591 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 SDT1YGL224C 843 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 YHR095WYHR095W 495 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1A-BRQ12217 YHR213WYHR213W 597 nt6.87□□□□□ -1.31
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