Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 OPY2YPR075C 1083 nt4.77□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt4.77□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 SEO1YAL067C 1782 nt4.77□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 SVF1YDR346C 1446 nt4.77□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 ERG4YGL012W 1422 nt4.77□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 YDL109CYDL109C 1944 nt4.77□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 DEG1YFL001W 1329 nt4.76□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 LHP1YDL051W 828 nt4.76□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 COQ4YDR204W 1008 nt4.76□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 CIA2YHR122W 696 nt4.76□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 LNP1YHR192W 837 nt4.76□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 YLR125WYLR125W 411 nt4.76□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 PPA2YMR267W 933 nt4.76□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 PCL1YNL289W 840 nt4.76□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 ECM23YPL021W 564 nt4.76□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 TGS1YPL157W 948 nt4.76□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 SAS10YDL153C 1833 nt4.76□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 HST1YOL068C 1512 nt4.76□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 NOP58YOR310C 1536 nt4.76□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 HER2YMR293C 1395 nt4.76□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 TRE1YPL176C 2352 nt4.76□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 CRT10YOL063C 2874 nt4.75□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 STB2YMR053C 2553 nt4.75□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 RAD16YBR114W 2373 nt4.75□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 NNK1YKL171W 2787 nt4.75□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 CTF18YMR078C 2226 nt4.75□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 SUR2YDR297W 1050 nt4.75□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 RPL34AYER056C-A 366 nt4.75□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 MOB2YFL034C-B 864 nt4.75□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 ERV14YGL054C 417 nt4.75□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 RMR1YGL250W 726 nt4.75□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 NVJ1YHR195W 966 nt4.75□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 YLR402WYLR402W 192 nt4.75□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 SNO1YMR095C 675 nt4.75□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 URE2YNL229C 1065 nt4.75□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.75□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 VHC1YBR235W 3363 nt4.75□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 ARG4YHR018C 1392 nt4.75□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 ALG6YOR002W 1635 nt4.75□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 CPS1YJL172W 1731 nt4.75□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 ZRC1YMR243C 1329 nt4.74□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 MNT2YGL257C 1677 nt4.74□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 RRB1YMR131C 1536 nt4.74□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 TFB3YDR460W 966 nt4.74□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 SPR6YER115C 576 nt4.74□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 YJR012CYJR012C 624 nt4.74□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 YMR082CYMR082C 357 nt4.74□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 COG5YNL051W 1212 nt4.74□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 SAP4YGL229C 2457 nt4.74□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 TMN2YDR107C 2019 nt4.73□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 NFI1YOR156C 2181 nt4.73□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 KRE6YPR159W 2163 nt4.73□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 SNA2YDR525W-A 240 nt4.73□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 YER085CYER085C 522 nt4.73□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 TIM21YGR033C 720 nt4.73□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 HFA1YMR207C 6372 nt4.73□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 YNG1YOR064C 660 nt4.73□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 TAF5YBR198C 2397 nt4.73□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 GAS2YLR343W 1668 nt4.73□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 ARC1YGL105W 1131 nt4.72□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 YHL049CYHL049C 816 nt4.72□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 ACP1YKL192C 378 nt4.72□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 UBI4YLL039C 1146 nt4.72□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 MFA2YNL145W 117 nt4.72□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 NAT3YPR131C 588 nt4.72□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 GAS5YOL030W 1455 nt4.72□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 BDP1YNL039W 1785 nt4.72□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 HRK1YOR267C 2280 nt4.72□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 TGL4YKR089C 2733 nt4.72□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 HIS4YCL030C 2400 nt4.72□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 MSE1YOL033W 1611 nt4.72□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 RAD28YDR030C 1521 nt4.72□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 MEF2YJL102W 2460 nt4.71□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 SKM1YOL113W 1968 nt4.71□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 GAD1YMR250W 1758 nt4.71□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 YMR111CYMR111C 1389 nt4.71□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 ARG82YDR173C 1068 nt4.71□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 DSD1YGL196W 1287 nt4.71□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 YGR269WYGR269W 327 nt4.71□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 COA3YJL062W-A 258 nt4.71□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 RGS2YOR107W 930 nt4.71□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 CAB3YKL088W 1716 nt4.71□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 NMD3YHR170W 1557 nt4.7□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 HOT1YMR172W 2160 nt4.7□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 SPR28YDR218C 1272 nt4.7□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 CAF16YFL028C 870 nt4.7□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 YGR016WYGR016W 573 nt4.7□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.7□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 CUS2YNL286W 858 nt4.7□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 TSL1YML100W 3297 nt4.7□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 SBE2YDR351W 2595 nt4.7□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 CPR4YCR069W 957 nt4.69□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 FMP33YJL161W 543 nt4.69□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 MHO1YJR008W 1017 nt4.69□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 DBR1YKL149C 1218 nt4.69□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 MIF2YKL089W 1650 nt4.69□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 THI20YOL055C 1656 nt4.69□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 TPO2YGR138C 1845 nt4.69□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 AKL1YBR059C 3327 nt4.69□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 SAC1YKL212W 1872 nt4.69□□□□□ -1.66
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