Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGL1

LAMTOR4, Ragulator complex protein LAMTOR4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR4Q0VGL1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMTOR4Q0VGL1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMTOR4Q0VGL1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMTOR4Q0VGL1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMTOR4Q0VGL1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMTOR4Q0VGL1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMTOR4Q0VGL1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMTOR4Q0VGL1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMTOR4Q0VGL1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMTOR4Q0VGL1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMTOR4Q0VGL1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMTOR4Q0VGL1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMTOR4Q0VGL1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMTOR4Q0VGL1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMTOR4Q0VGL1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMTOR4Q0VGL1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMTOR4Q0VGL1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMTOR4Q0VGL1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMTOR4Q0VGL1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMTOR4Q0VGL1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMTOR4Q0VGL1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMTOR4Q0VGL1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMTOR4Q0VGL1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMTOR4Q0VGL1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMTOR4Q0VGL1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMTOR4Q0VGL1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms