Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMOD3Q0VAK6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms