Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms