Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXM1Q08050 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms