Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG1Q06432 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms