Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms