Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTF1Q05048 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms