Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNB1Q02641 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB1Q02641 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB1Q02641 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms