Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLCB3Q01970 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLCB3Q01970 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLCB3Q01970 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLCB3Q01970 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLCB3Q01970 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLCB3Q01970 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLCB3Q01970 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLCB3Q01970 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLCB3Q01970 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLCB3Q01970 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLCB3Q01970 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLCB3Q01970 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLCB3Q01970 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLCB3Q01970 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PLCB3Q01970 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLCB3Q01970 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLCB3Q01970 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLCB3Q01970 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PLCB3Q01970 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PLCB3Q01970 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PLCB3Q01970 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms