Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms