Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB2Q00653 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms