Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNAQ00169 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms