Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms