Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms