Protein–RNA interactions for Protein: P62333

PSMC6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC6P62333 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC6P62333 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSMC6P62333 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMC6P62333 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMC6P62333 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms